You are viewing an old version of this page. View the current version.

Compare with Current View Page History

« Previous Version 33 Next »

Please move your personal culture collection to lab. stock when you graduate. Stock tubes, glycerols and mediums are supplied. Ask Yutaka.

BOX 01 (Ocean Microbes / Microbes require salinity)

 

NAME

NOTE

SUGGESTED MEDIUM/CONDITION

ANTIBIOTICS

Made By

A1

Vibrio alginolyticus 12G01

 

2216 / RT~30

 

 

A2

Vibrio alginolyticus YM4

 

2216 / RT~30

 

 

A3

P. haloplanktis

 

 

 

 

A4

P. haloplanktis

 

 

 

 

A5

Vibrio cycrotrophicus ZF30

 

 

 

 

 

 

A6

Vibrio cycrotrophicus ZF99

 

 

 

 

 

 

A7

Vibrio cycrotrophicus ZF205

 

 

 

 

 

 

A8

Vibrio cycrotrophicus ZF28

 

 

 

 

 

 

A9

Vibrio cycrotrophicus FF160

 

 

 

 

 

 

B1

Vibrio cycrotrophicus 1F53

 

 

 

 

 

 

B2

Vibrio cycrotrophicus
1F97

 

 

 

 

 

 

B3

Vibrio alginolyticus NMB102

backward smooth swimming

Mixture

 

 

B4

Vibrio alginolyticus NMB136

forward smooth swimming

Mixture

 

 

B5

Vibrio alginolyticus NMB102

backward smooth swimming

Single Colony

 

 

B6

Vibrio alginolyticus NMB136

forward smooth swimming

Single Colony

 

 

B7

 

 

 

 

 

B8

 

 

 

 

 

B9

 

 

 

 

 

C1

Marinobacter aquaeolei VT8 (from ATCC)

 

frozen in 2216 media

n/a

steve

C2

Marinobacter aquaeolei VT8 (from ATCC)

 

frozen in Halomonas media

n/a

steve

C3

 

 

 

 

 

C4

 

 

 

 

 

C5

 

 

 

 

 

C6

 

 

 

 

 

C7

 

 

 

 

 

C8

 

 

 

 

 

C9

 

 

 

 

 

D1

 

 

 

 

 

D2

 

 

 

 

 

D3

 

 

 

 

 

D4

 

 

 

 

 

D5

 

 

 

 

 

D6

 

 

 

 

 

D7

 

 

 

 

 

D8

 

 

 

 

 

D9

 

 

 

 

 

E1

 

 

 

 

 

E2

 

 

 

 

 

E3

 

 

 

 

 

E4

 

 

 

 

 

E5

 

 

 

 

 

E6

 

 

 

 

 

E7

 

 

 

 

 

E8

 

 

 

 

 

E9

 

 

 

 

 

G1

 

 

 

 

 

G2

 

 

 

 

 

G3

 

 

 

 

 

G4

 

 

 

 

 

G5

 

 

 

 

 

G6

 

 

 

 

 

G7

 

 

 

 

 

G8

 

 

 

 

 

G9

 

 

 

 

 

H1

 

 

 

 

 

H2

 

 

 

 

 

H3

 

 

 

 

 

H4

 

 

 

 

 

H5

 

 

 

 

 

H6

 

 

 

 

 

H7

 

 

 

 

 

H8

 

 

 

 

 

H9

 

 

 

 

 

I1

 

 

 

 

 

I2

 

 

 

 

 

I3

 

 

 

 

 

I4

 

 

 

 

 

I5

 

 

 

 

 

I6

 

 

 

 

 

I7

 

 

 

 

 

I8

 

 

 

 

 

I9

 

 

 

 

 

BOX 02 (Non-Ocean Microbes / Microbes doesn't require salinity)

 

NAME

NOTE

SUGGESTED MEDIUM/CONDITION

ANTIBIOTICS

Made By

A1

E.Coli AW405

from H. Berg 

TB, LB

 

 

A2

E.coli VS100

smooth swimmer 

 

 

 

A3

E.coli VS100 

smooth swimmer 

 

 

 

A4

B. subtilis OI1085

 

CAM Complete / ~37

 

Marcos

A5

B. subtilis OI1085

 

 

 

Marcos 

A6 

B. subtilis OI4139

smooth swimmer

CAM Complete + 1mM IPTG / ~37

 

Marcos 

A7

B. subtilis OI4139

smooth swimmer

 

 

Marcos 

A8 

B. subtilis OI4139

smooth swimmer

 

 

Marcos 

A9

 

 

 

 

 

B1

 

 

 

 

 

B2

 

 

 

 

 

B3

 

 

 

 

 

B4

 

 

 

 

 

B5

 

 

 

 

 

B6

 

 

 

 

 

B7

 

 

 

 

 

B8

 

 

 

 

 

B9

 

 

 

 

 

C1

 E. coli UU1615

 Parkinson lab, Tsr-only

 tryptone

 

 Noele

C2

 E. coli UU1615

 

 

 

 Noele

C3

 E. coli UU1624

 Parkinson lab, Tar-only

 tryptone

 

 Noele

C4

 E. coli UU1624

 

 

 

 Noele

C5

 

 

 

 

 

C6

 

 

 

 

 

C7

 

 

 

 

 

C8

 

 

 

 

 

C9

 

 

 

 

 

D1

 

 

 

 

 

D2

 

 

 

 

 

D3

 

 

 

 

 

D4

 

 

 

 

 

D5

 

 

 

 

 

D6

 

 

 

 

 

D7

 

 

 

 

 

D8

 

 

 

 

 

D9

 

 

 

 

 

E1

 

 

 

 

 

E2

 

 

 

 

 

E3

 

 

 

 

 

E4

 

 

 

 

 

E5

 

 

 

 

 

E6

 

 

 

 

 

E7

 

 

 

 

 

E8

 

 

 

 

 

E9

 

 

 

 

 

G1

 

 

 

 

 

G2

 

 

 

 

 

G3

 

 

 

 

 

G4

 

 

 

 

 

G5

 

 

 

 

 

G6

 

 

 

 

 

G7

 

 

 

 

 

G8

 

 

 

 

 

G9

 

 

 

 

 

H1

 

 

 

 

 

H2

 

 

 

 

 

H3

 

 

 

 

 

H4

 

 

 

 

 

H5

 

 

 

 

 

H6

 

 

 

 

 

H7

 

 

 

 

 

H8

 

 

 

 

 

H9

 

 

 

 

 

I1

 

 

 

 

 

I2

 

 

 

 

 

I3

 

 

 

 

 

I4

 

 

 

 

 

I5

 

 

 

 

 

I6

 

 

 

 

 

I7

 

 

 

 

 

I8

 

 

 

 

 

I9

 

 

 

 

 

BOX 09 (Non-Ocean Microbes / Microbes doesn't require salinity)

 

NAME

NOTE

SUGGESTED MEDIUM/CONDITION

ANTIBIOTICS

MADE BY

A-B1PA01 dpsl mch    
A-B2PA01 dpsl     
A-B3PA01 pbad    
A-B4PA01 dalg    
A-B5PA01 dpel    
A-B6PA01     
A-B7PA01 mch    
A-B8PA14    
      
      

 

Pseudomonas aeruginosa PAO1 886

 

 

 

HJ

 

Pseudomonas aeruginosa PAO1 ΔlasR

 

 

 

HJ

 

Pseudomonas aeruginosa PA14 2367

 

 

 

HJ

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

BOX 10 (Non-Ocean Microbes / Microbes doesn't require salinity)

 

NAME

NOTES

SUGGESTED MEDIUM/CONDITION

ANTIBIOTICS

MADE BY

1

Pseudomonas aeruginosa ???

 

 

 

HJ

2

Pseudomonas aeruginosa ???

 

 

 

HJ

3

Pseudomonas aeruginosa PA14 ???

 

 

 

HJ

4

Pseudomonas aeruginosa ???

 

 

 

HJ

5

Pseudomonas aeruginosa PA14 - Flgk - YFP 

Flagella mutant ???

 

 

HJ

6

Pseudomonas aeruginosa PA14 - Flgk - CFP

Flagella mutant ???

 

 

HJ

7

Pseudomonas aeruginosa ???

 

 

 

HJ

8

Pseudomonas aeruginosa ???

 

 

 

HJ

9

Pseudomonas aeruginosa ???

 

 

 

HJ

10

Pseudomonas aeruginosa ???

 

 

 

HJ

 

Pseudomonas aeruginosa Δpel

PA01 ???; matrix mutant ???

 

 

HJ

 

Pseudomonas aeruginosa PAO1 AlgD

alginate mutant ???

 

 

HJ

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

  • No labels